Zuru adında genç bir kız, çaresiz bir yiyecek avı için makineler tarafından kontrol edilen kıyamet sonrası bir şehirde bir keşif gezisine çıkar. Ekibi kazara şehrin Safeguard adlı yapay zeka savunma programını tetiklediğinde işler ters gider. Makinelerin saldırısına uğrayan arkadaşları, Killy adında gizemli bir adam gelip düşman birimleri yok ettiğinde yok olmanın eşiğindedir.
Kahramanca müdahalesine rağmen Zuru, Killy’ye güvenmekte tereddüt eder ve onun amacını sorgular. İnsanların medeniyetlerinin kontrolünü yeniden kazanmasına ve Koruma Muhafızını kapatmasına izin verecek bir özellik olan Net Terminal Genlerine sahip insanları bulmak için şehrin altındaki binlerce seviyeden geldiğini ortaya koyuyor. Hikayesini dinledikten sonra Zuru ve ekibinin geri kalanı, Killy’ye katılır ve insanlığın hayatta kalmak için son umudu olduğunu kanıtlayabilecek Genleri aramak için bir yolculuğa çıkar.
