On yedi yaşındaki Jirou Azuma, hayvanlarla konuşma yeteneğini kullanarak onlarla dostluk kurup onları korurken, büyükbabasıyla birlikte sakin bir hayat sürmektedir. Hem Jirou hem de büyükbabası, köklü bir shinobi klanının torunlarıdır ve savaş sanatını aileleri içinde yaşatmak için dövüş eğitimi almaktadırlar. Jirou’nun hayatı, görünüşte sıradan bir kara kedi olan Ragou’yu kurtardıktan sonra altüst olur; ancak kısa süre sonra kedinin aslında insanlıkla uzun süredir savaş halinde olan şeytani bir ruh olan bir mononoke olduğunu keşfeder. Düşmanca niyetli bir mononoke Ragou’yu aramaya geldiğinde, Jirou shinobi eğitimini kullanarak kediyi korumak için harekete geçer, ancak hemen ölümcül bir yara alır.
Jirou’nun azalan enerjisini yutup tam gücüne kavuşup kavuşmama kararının eşiğinde kalan Ragou, bunun yerine kalan enerjisini Jirou’ya vermeyi seçer. Çocuğu hayata döndüren bu enerji aktarımı, ona kendi shinobi dövüş stilini tamamlayan muazzam doğaüstü güçler de kazandırır. Bu olaya, görevi saldırgan mononokeleri ortadan kaldırmak olan Casusluk Bürosu’ndan bir memur olan Ryousuke Shiba tanık olur. Shiba, Jirou ve büyükbabasına bir teklifte bulunur: Büro’nun yeni ekibi olan Black Torch’a katılıp, masum insanları yutmaya çalışan güçlü mononokelerle savaşmalarına yardım etmeleri.